用qq邮箱给edu邮箱发邮件会拦截吗?

不会，

支持注册任何需要邮箱的平台和全世界使用及收发。

支持设置为【英文@qq.com】【手机@qq.com】【用户名@foxmail.com】商务两用，

这个功能是实现一个邮箱拥有多个邮箱地址，意思是所有设置的邮箱地址都会收到同一个邮箱。